De 1726 à 1768 l’Académie eut un seul secrétaire perpétuel.
De 1768 à 1793 et de 1803 à 1869 elle eut un secrétaire perpétuel des Lettres et un autre des Sciences.
De 1869 à 2005, à nouveau un seul secrétaire perpétuel.
Depuis 2005, deux secrétaires perpétuels ont été rétablis.
Secrétaire perpétuel unique (1726-1767)
- Antoine-Louis DE CHALAMONT DE LA VISCLÈDE (1/1-21) de 1726 à 1760.
- Paul-Alexandre DULARD (8/1-6) avait été secrétaire en service pendant les dernières années de son prédécesseur et lui succéda à sa mort le 22 août 1760. Il mourut lui-même le 7 décembre 1760
- Honoré-César RICAUD (9/4-52) de 1760 à 1768. Offrit en mai 1764 sa démission pour raisons de santé. L’Académie lui conserva le titre mais le remplaça par des « secrétaires annuels en absence » jusqu’à la création effective en 1768 des deux classes des Lettres et Sciences, dotées chacune d’un secrétaire perpétuel. Il s’agit d’Esprit-Joseph SÉREN (14/4-38) pour 1764, Louis-Nicolas DE VENTO marquis DES PENNES (7/2-36) pour 1765, Dominique AUDIBERT (6/3-59) pour 1766 (voir plus bas), Gabriel DE VILLENEUVE (10/3-64) pour 1767.
Secrétaires perpétuels des classes de Lettres et de Sciences (1768-1793)
- Jean-François-Ange D’EYMAR (2/2-60) pour les Lettres de 1768 à 1774.
- Raymond-Jean MOURRAILLE (22/1-65) pour les Sciences de 1768 à 1782. Fut de 1774 à 1781 le seul secrétaire perpétuel de facto ; il l’avait sans doute été auparavant, s’entendant mal avec son confrère des Lettres.
- Pierre-Augustin GUYS (19/3-46) pour les Lettres de 1781à 1784 – il demanda alors la vétérance.
- Louis-Joseph-Denis DE BORÉLY (16/5-61) fut secrétaire pour les Sciences par intérim en 1782.
- Joseph Balthazar ROBINEAU de BEAULIEU (4/1-72) pour les Sciences de 1782 à 1785.
- Dominique AUDIBERT (6/3-59) pour les Lettres de 1784 à 1787.
- Dominique BERTRAND (21/3-79) pour les Sciences de 1785 à 1787.
- Joseph CAPUS (16/6-86) pour les Lettres de 1787 à 1793.
- Joseph-Pons BERNARD (8/3-83) pour les Sciences de 1787 à 1793.
- Claude-François ACHARD (23/2-89), secrétaire par intérim en 1793, il sauva les archives de l’Académie et joua un rôle essentiel dans sa reconstitution (voir plus bas).
Secrétaires temporaires du Lycée des Arts
- Jean-Pierre CHIRAC (f. éphémère -98), secrétaire temporaire du 17 germinal an VII/6 avril 1799-au 25 ventôse an VIII/16 mars 1800.
- Charles-Pierre BRACK (f. éphémère-116), secrétaire temporaire du 25 ventôse an VIII/ 16 mars 1800 au 25 ventôse an IX/ 16 mars 1801.
- Esprit DE SINÉTY DE PUYLONG (22/3-121), secrétaire temporaire [pour les Lettres ?] du 15 fructidor an VIII/2 septembre 1800 au 5 vendémiaire an X/27 septembre 1801 (voir plus bas).
- Jean-Jacques BLANPAIN (12/5-103), secrétaire temporaire [d’abord pour les Sciences ?] du 25 ventôse an IX/ 16 mars 1801 au 26 fructidor an XI/ 13 septembre 1803.
- Camille GIRARD (3/6-134), secrétaire temporaire du 25 ventôse an IX/ 16 mars 1801 au 26 fructidor an XI/13 septembre 1803.
Secrétaires perpétuels des classes de Lettres et de Sciences de l’Académie (1803-1869)
- Claude-François ACHARD (23/2-89), secrétaire perpétuel pour les Lettres du 26 fructidor an XI/13 septembre 1803 à 1809.
- Esprit DE SINÉTY DE PUYLONG (22/3-121), secrétaire perpétuel pour les Sciences du 26 fructidor an XI à 1811.
- Casimir ROSTAN (1/4-150) pour les Lettres de 1809 à 1817.
- Jean-Vincent MARTIN (30/2-164) pour les Sciences de 1811 à 1816.
- Jean-Baptiste LAUTARD (22/4-168) pour les Sciences de 1816 à 1855, historien de l’Académie.
- Simon Célestin CROZE-MAGNAN (32/2-170) pour les Lettres de 1817 à 1818.
- Louis-François JAUFFRET (19/7-187) pour les Lettres de 1818 à 1840.
- Paul AUTRAN (11/6-193) pour les Lettres de 1841 à 1869.
- Joseph TEMPIER (9/7-243) pour les Sciences de 1855 à 1866.
- Louis-Toussaint DASSY (23/6-264) pour les Sciences de 1866 à 1869 (voir ci-dessous).
Secrétaire perpétuel unique (1869-2005)
- Louis-Toussaint DASSY, de 1869 à 1889, historien de l’Académie.
- Louis BLANCARD (13/12-271) de 1889 à 1902.
- Ludovic LEGRÉ (11/7-286), secrétaire adjoint de 1874 à 1879 et 1899-1902. Secrétaire perpétuel de 1902 à 1904. Mort le 11 mai 1904 dans le bureau des secrétaires perpétuels à l’hôtel de l’Académie.
- Émile PENCHINAT (24/11-339), secrétaire adjoint, 1902-1904. Secrétaire perpétuel de 1904 à 1909.
- Stanislas GAMBER (2/11-349), secrétaire adjoint, 1905-1909. Secrétaire perpétuel de 1909 à 1941. Décédé des suites d’une chute dans l’escalier de l’hôtel de l’Académie.
- Joseph FOURNIER (25/9-371), secrétaire adjoint, 1925-1940. Secrétaire perpétuel de 1941 à 1948, historien de l’Académie.
- Raymond BOURGAREL-PROU-GAILLARD (16/16-424), secrétaire adjoint, 1941-1943 et 1944-1949. Secrétaire perpétuel de 1949 à 1956.
- André BOULAYA D’ARNAUD (17/17-453), secrétaire adjoint, 1951-1956. Secrétaire perpétuel de 1956 à 1967.
- Francis J. P. CHAMANT (40/10-458), de 1967 à 1990.
- Georges BERGOIN (34/7-496), de 1990 à 2005.
Secrétaires perpétuels des classes de Lettres et de Sciences (élection du 3 novembre 2005)